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浪潮天梭中標南方醫科大生物信息系統項目

來源: 瀏覽次數: 2007-01-01

  近日,在南方醫科大學生物信息技術系統項目招標中,基于四核處理平臺的浪潮天梭TS10000高性能科學計算系統成功中標。據了解,采用四核處理單元構建的TS10000高性能科學計算系統在廣東省還是首次,此次成功應用將把廣東省的生物信息計算水平提高到一個新的水平。

  生物信息研究是當今世界科技發展的熱點之一,在食品、制藥、疾病防治等眾多領域廣泛應用。南方醫科大學醫學信息檢測技術重點實驗室隸屬于南方醫科大學基礎醫學院腫瘤研究所,長期致力于生物信息技術的分析和科研工作,曾經成功發現SARS病毒致命的主要物質成分,為治療SARS藥物的問世提供了可能。但是,現代生物信息研究對大規?茖W計算有很深的依賴,平臺性能對于科研進度及質量影響很大,南方醫科大學醫學信息檢測技術重點實驗室負責人表示,此次采用代表我國計算機業最高技術水平的浪潮天梭系統,將極大提高實驗室的大規模數據處理能力!

  此次浪潮中標關鍵正是在于掌握了用戶應用需求脈搏。隨著實驗室的不斷的發展,亟需一套高性能服務器平臺,綜合運用計算機科學、生物學的各種工具來闡明和理解大量數據所包含的生物學意義。通過高性能服務器集群的并行算法,對獲取的生物信息進行分配、分析、存儲、解釋,同時,還要滿足基因比對排列運算、基因語言與調控、功能基因組學等自行開發的應用需要。浪潮服務器的負責人介紹,這種應用兼有計算密集型和通訊密集型的特點,浪潮提供的基于Intel四核處理節點平臺的天梭TS10000集群系統,采用5+1的計算/管理配備方案,處理核心總數達到了40個,通過千兆以太網絡進行各節點間的并行通訊和高速交換運算,充分滿足客戶對高性能計算系統的需要。在具體實施中,這套天梭TS10000高性能集群系統性能卓越、穩定的運行各類軟件,并行效率與加速比分別高達80%和1.7,實際表現大大超出了用戶預期。

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